This script illustrates how to perform multiple imputation when missing data are assumed to be Missing Not At Random (MNAR). It begins by creating a synthetic dataset ('Fcs1') with simulated missing values. Then, it uses `PROC MI` with the `FCS` (Fully Conditional Specification) option and the `MNAR` statement to adjust the imputed values of variables `y1` and `y2` specifically for the treatment group `Trt='1'`, by applying shifts.
Datenanalyse
Type : CREATION_INTERNE
The data are artificially generated in the DATA step `Fcs1` using loops and random number generation functions (`rannor`, `ranuni`) to simulate clinical trial data.
1 Codeblock
DATA STEP Data
Erklärung : Creation of the `Fcs1` dataset. Generates `y0`, `y1`, `y2` variables based on a normal distribution and randomly introduces missing values (`.`) for `y1` or `y2`.
Kopiert!
data Fcs1;
do Trt=0 to 1;
do j=1 to 5;
y0=10 + rannor(99);
y1= y0 + 0.9*Trt + rannor(99);
y2= y0 + 0.9*Trt + rannor(99);
if (ranuni(99) < 0.3) then y1=.;
else if (ranuni(99) < 0.3) then y2=.;
output;
end; end;
do Trt=0 to 1;
do j=1 to 45;
y0=10 + rannor(99);
y1= y0 + 0.9*Trt + rannor(99);
y2= y0 + 0.9*Trt + rannor(99);
if (ranuni(99) < 0.3) then y1=.;
else if (ranuni(99) < 0.3) then y2=.;
output;
end; end;
drop j;
run;
1
DATA Fcs1;
2
DO Trt=0 to 1;
3
DO j=1 to 5;
4
y0=10 + rannor(99);
5
y1= y0 + 0.9*Trt + rannor(99);
6
y2= y0 + 0.9*Trt + rannor(99);
7
IF (ranuni(99) < 0.3) THEN y1=.;
8
ELSEIF (ranuni(99) < 0.3) THEN y2=.;
9
OUTPUT;
10
END; END;
11
DO Trt=0 to 1;
12
DO j=1 to 45;
13
y0=10 + rannor(99);
14
y1= y0 + 0.9*Trt + rannor(99);
15
y2= y0 + 0.9*Trt + rannor(99);
16
IF (ranuni(99) < 0.3) THEN y1=.;
17
ELSEIF (ranuni(99) < 0.3) THEN y2=.;
18
OUTPUT;
19
END; END;
20
drop j;
21
RUN;
2 Codeblock
PROC PRINT
Erklärung : Displays the first 10 observations of the generated dataset for verification.
Kopiert!
proc print data=Fcs1(obs=10);
var Trt Y0 Y1 Y2;
title 'First 10 Obs in the Trial Data';
run;
1
PROC PRINTDATA=Fcs1(obs=10);
2
var Trt Y0 Y1 Y2;
3
title 'First 10 Obs in the Trial Data';
4
RUN;
3 Codeblock
PROC MI Data
Erklärung : Performs multiple imputation. Uses the `FCS` method with 25 iterations. The `MNAR` statement applies an adjustment (shift of -0.4 for `y1` and -0.5 for `y2`) only for observations where `Trt='1'`, simulating a bias for missing data.
Kopiert!
proc mi data=Fcs1 seed=52387 out=outex16;
class Trt;
fcs nbiter=25 reg( /details);
mnar adjust( y1 /shift=-0.4 adjustobs=(Trt='1'))
adjust( y2 /shift=-0.5 adjustobs=(Trt='1'));
var Trt y0 y1 y2;
run;
1
PROC MIDATA=Fcs1 seed=52387 out=outex16;
2
class Trt;
3
fcs nbiter=25 reg( /details);
4
mnar adjust( y1 /shift=-0.4 adjustobs=(Trt='1'))
5
adjust( y2 /shift=-0.5 adjustobs=(Trt='1'));
6
var Trt y0 y1 y2;
7
RUN;
4 Codeblock
PROC PRINT
Erklärung : Displays the first 10 observations of the output dataset `outex16`, which contains the imputed data.
Kopiert!
proc print data=outex16(obs=10);
var _Imputation_ Trt y0 y1 y2;
title 'First 10 Observations of the Imputed Data Set';
run;
1
PROC PRINTDATA=outex16(obs=10);
2
var _Imputation_ Trt y0 y1 y2;
3
title 'First 10 Observations of the Imputed Data Set';
4
RUN;
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