Exemple 1 pour PROC ICPHREG

Niveau de difficulté

Débutant

Publié le : 23/04/2023

Le script commence par créer un jeu de données nommé 'hiv' contenant des informations sur la progression d'une maladie, avec des temps d'observation censurés à gauche et à droite. Il utilise ensuite la procédure ICPHREG de trois manières différentes pour modéliser ces données : un premier modèle de base, un second modèle spécifiant une fonction de risque de base constante par morceaux (piecewise constant hazard), et un troisième modèle qui calcule les Hazard Ratios pour la variable de stade de la maladie.

Analyse des données

Type : CREATION_INTERNE

Les données sont créées directement dans le script via une étape DATA et une instruction 'datalines'. Les valeurs 0 pour la borne inférieure (Left) et les valeurs >= 26 pour la borne supérieure (Right) sont converties en valeurs manquantes pour gérer la censure des données.

1 Bloc de code

DATA STEP Data

Explication :
Ce bloc crée la table SAS 'hiv' à partir de données intégrées ('datalines'). Il définit les variables Left, Right, Stage, Dose, CdLow, et CdHigh. Les instructions conditionnelles 'if' transforment certaines valeurs en données manquantes SAS ('.') pour représenter correctement les données de survie censurées.

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1	DATA hiv;
2	INPUT Left Right Stage Dose CdLow CdHigh;
3	IF (Left=0) THEN Left=.;
4	IF (Right>=26) THEN Right=.;
5	DATALINES;
6	0 16 0 0 0 1
7	15 26 0 0 0 1
8	12 26 0 0 0 1
9	17 26 0 0 0 1
10	13 26 0 0 0 1
11	0 24 0 0 1 0
12	6 26 0 1 1 0
13	0 15 0 1 1 0
14	14 26 0 1 1 0
15	12 26 0 1 1 0
16	13 26 0 1 0 1
17	12 26 0 1 1 0
18	12 26 0 1 1 0
19	0 18 0 1 0 1
20	0 14 0 1 0 1
21	0 17 0 1 1 0
22	0 15 0 1 1 0
23	3 26 1 0 0 1
24	4 26 1 0 0 1
25	1 11 1 0 0 1
26	13 19 1 0 0 1
27	0 6 1 0 0 1
28	0 11 1 1 0 0
29	6 26 1 1 0 0
30	0 6 1 1 0 0
31	2 12 1 1 0 0
32	1 17 1 1 1 0
33	0 14 1 1 0 0
34	0 25 1 1 0 1
35	2 11 1 1 0 0
36	0 14 1 1 0 0
37	;
38

2 Bloc de code

PROC ICPHREG

Explication :
Ce bloc exécute un modèle de régression à risques proportionnels pour données censurées par intervalle. La variable de réponse est l'intervalle de temps (Left, Right). Les variables explicatives sont 'Stage' et 'Dose', traitées comme des variables de classification. L'option 'desc' sur l'instruction CLASS ordonne les niveaux de ces variables de manière décroissante.

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1	PROC ICPHREG DATA=hiv;
2	class Stage Dose / desc;
3	model (Left, Right) = Stage Dose;
4	RUN;

3 Bloc de code

PROC ICPHREG

Explication :
Cette seconde exécution de PROC ICPHREG inclut deux options supplémentaires. 'ithistory' affiche l'historique d'itération de l'ajustement du modèle. 'basehaz=pch(intervals=(10))' spécifie que la fonction de risque de base doit être modélisée comme une fonction constante par morceaux avec un point de rupture à 10.

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1	PROC ICPHREG DATA=hiv ithistory;
2	class Stage Dose / desc;
3	model (Left, Right) = Stage Dose / basehaz=pch(intervals=(10));
4	RUN;

4 Bloc de code

PROC ICPHREG

Explication :
Ce troisième modèle se concentre sur l'effet de la variable 'Stage'. L'instruction 'hazardratio Stage' est ajoutée pour demander le calcul et l'affichage des rapports de risque (Hazard Ratios) pour les différents niveaux de la variable 'Stage', permettant de quantifier l'effet de cette variable sur le risque.

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1	PROC ICPHREG DATA=hiv;
2	class Stage / desc;
3	model (Left, Right) = Stage / basehaz=pch(intervals=(10));
4	hazardratio Stage;
5	RUN;

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