Création du jeu de données SDTM DM

Niveau de difficulté

Débutant

Publié le : 30/07/2023

Le script commence par définir le chemin du référentiel GitHub local et supprime les macros précédemment définies pour assurer la propreté de l'environnement. Il configure ensuite les options SAS^© pour inclure les macros personnalisées dans le chemin spécifié et attribue des libnames pour les données SDTM et les métadonnées. La macro %dm_create est appelée avec des paramètres pour générer un jeu de données démographique (dm10) avec un nombre spécifié de sujets, de sites, de pays, de dates, et de probabilités. Enfin, la macro %sdtm_attrs est utilisée pour finaliser les attributs du jeu de données généré (dm10) selon les standards SDTM et l'enregistre en tant que sdtm.dm.

Analyse des données

Type : CREATION_INTERNE

Le jeu de données 'dm10' est créé en interne par la macro %dm_create, qui génère des données de manière programmatique basées sur les paramètres fournis (nombre de sujets, pays, sexe, etc.). Le jeu de données final 'sdtm.dm' est une version enrichie de 'dm10'.

1 Bloc de code

Configuration

Explication :
Ce bloc initialise des variables macro (`path`, `seed`), supprime d'anciennes définitions de macros pour assurer la propreté de l'environnement, configure l'option `mprint` pour le débogage des macros et ajoute le chemin des macros personnalisées à `sasautos`. Il définit également les bibliothèques `sdtm` et `meta` pour l'accès aux données et aux métadonnées.

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1	%let path = H:\GitHub\srosanba\sas-sdtm-simulator;
2
3	%sysmacdelete list2format / nowarn;
4	%sysmacdelete required / nowarn;
5	%sysmacdelete dm_create / nowarn;
6	%sysmacdelete sdtm_attrs / nowarn;
7
8	options mprint sasautos=("&path/macros" sasautos);
9
10	LIBNAME sdtm "&path/data";
11	LIBNAME meta "&path/meta" access=readonly;
12
13	%let seed = 8675309;

2 Bloc de code

Macro %dm_create Data

Explication :
La macro %dm_create est appelée pour générer un nouveau jeu de données nommé `dm10`. Les paramètres spécifient le nombre de sujets et de sites, la liste et les proportions de pays, les dates de la première et de la dernière visite du premier sujet, la durée de dépistage, de traitement et de suivi, la probabilité de décès, et la distribution par sexe.

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1	*---------- create dm dataset ----------;
2	%dm_create
3	(out=dm10
4	,subjid_n=40
5	,siteid_n=5
6	,country_list=(USA,CAN,MEX)
7	,country_table=(.6,.2,.2)
8	,fpfvdt=01oct2016
9	,lpfvdt=01apr2017
10	,screendur=3
11	,treatdur=182
12	,followupdur=28
13	,deathprob=0.05
14	,sex_table=(.6,.4)
15	);

3 Bloc de code

Macro %sdtm_attrs

Explication :
La macro %sdtm_attrs est utilisée pour appliquer les attributs standard du modèle SDTM (Study Data Tabulation Model) au jeu de données `dm10` précédemment créé. Le jeu de données résultant, avec les attributs finalisés, est enregistré sous le nom `sdtm.dm` dans la bibliothèque `sdtm`.

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1	*---------- finalize attributes ----------;
2	%sdtm_attrs
3	(DATA=dm10
4	,out=sdtm.dm
5	,domain=dm
6	);

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