Exemple de Documentation pour PROC INBREED

Le script commence par une étape DATA qui crée un jeu de données nommé 'Monoecious'. Les données sont directement intégrées dans le script via l'instruction DATALINES, définissant les variables 'Generation', 'Individual', 'Parent1', 'Parent2' et 'Covariance'. La référence `@code_sas^©_json/hsdua2304@gmail.com_SAS^©_Assignment_1.json` dans l'instruction INPUT est syntaxiquement incorrecte pour SAS^© dans ce contexte et serait une erreur si le code était exécuté tel quel. L'objectif de cette étape est de préparer des données généalogiques pour l'analyse. Ensuite, la procédure PROC INBREED est appelée avec les options 'IND', 'COVAR' et 'MATRIX' pour calculer les coefficients de consanguinité et les matrices de covariance. L'instruction CLASS 'Generation' est utilisée pour grouper les analyses par génération, ce qui permet à la procédure de traiter les relations au sein de chaque groupe de génération spécifié. Ce script est typique pour les analyses statistiques génétiques.

Analyse des données

Type : CREATION_INTERNE

Les données utilisées par le script sont créées directement au sein de l'étape DATA 'Monoecious' à l'aide de l'instruction 'datalines'. Aucune source de données externe valide n'est utilisée pour l'alimentation du jeu de données principal.

1 Bloc de code

DATA STEP Data

Explication :
Ce bloc DATA STEP est responsable de la création du jeu de données 'Monoecious'. Les variables 'Generation', 'Individual', 'Parent1', 'Parent2' et 'Covariance' sont définies via l'instruction INPUT. Les données sont ensuite fournies en ligne à l'aide du bloc DATALINES. Il est important de noter que la partie `@code_sas_json/hsdua2304@gmail.com_SAS_Assignment_1.json` après 'Covariance' dans l'instruction INPUT est une anomalie syntaxique et ne correspond pas à une fonctionnalité SAS standard pour inclure des fichiers JSON comme données ou métadonnées dans un DATA STEP de cette manière. Dans une exécution SAS, cela provoquerait une erreur ou une interprétation incorrecte des données.

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1	DATA Monoecious;
2	INPUT Generation Individual Parent1 Parent2 Covariance @code_sas_json/hsdua2304@gmail.com_SAS_Assignment_1.json;
3	DATALINES;
4	1 1 . . . 1 2 . . . 1 3 . . .
5	2 1 1 1 . 2 2 1 2 . 2 3 2 3 .
6	3 1 1 2 . 3 2 1 3 . 3 3 2 1 .
7	3 4 1 3 . 3 . 2 3 0.50 3 . 4 3 1.135
8	;

2 Bloc de code

PROC INBREED

Explication :
Ce bloc utilise PROC INBREED pour effectuer une analyse statistique sur le jeu de données 'Monoecious'. L'option 'IND' demande le calcul des coefficients de consanguinité. Les options 'COVAR MATRIX' produisent les matrices de covariance des coefficients de consanguinité. L'instruction 'CLASS Generation;' indique que les calculs doivent être effectués en tenant compte de la variable 'Generation', ce qui est essentiel pour les données de pedigrees structurées par générations. Le titre 'Inbreeding within Nonoverlapping Generations' est défini pour les sorties générées par cette procédure.

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1	title 'Inbreeding within Nonoverlapping Generations';
2	PROC INBREED ind covar matrix DATA=Monoecious;
3	class Generation;
4	RUN;

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