Exemple 2 PROC ICLIFETEST - Données Cosmétiques

Ce script analyse les effets cosmétiques de deux traitements contre le cancer du sein (Radiothérapie 'RT' vs Radio-chimiothérapie 'RCT'). Il crée les données via des étapes DATA, puis utilise la procédure ICLIFETEST pour estimer les fonctions de survie, effectuer des comparaisons entre les groupes (strates) et générer des graphiques de survie avec intervalles de confiance. L'option 'impute' est utilisée pour gérer la censure par intervalle via l'imputation multiple.

Analyse des données

Type : CREATION_INTERNE

Les données sont créées directement dans le script via l'instruction DATALINES. Deux tables (RT et RCT) sont créées puis concaténées dans la table finale BCS.

1 Bloc de code

DATA STEP Data

Explication :
Création des jeux de données brutes pour chaque groupe de traitement. L'instruction 'input lTime rTime @@;' (corrigée par rapport à l'artefact du prompt) permet de lire plusieurs paires d'observations sur une même ligne. Les deux tables sont ensuite empilées dans la table 'BCS'.

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1	DATA RT;
2	INPUT lTime rTime @@;
3	trt = ' RT';
4	DATALINES;
5	45 . 25 37 37 .
6	6 10 46 . 0 5
7	0 7 26 40 18 .
8	46 . 46 . 24 .
9	46 . 27 34 36 .
10	7 16 36 44 5 11
11	17 . 46 . 19 35
12	7 14 36 48 17 25
13	37 44 37 . 24 .
14	0 8 40 . 32 .
15	4 11 17 25 33 .
16	15 . 46 . 19 26
17	11 15 11 18 37 .
18	22 . 38 . 34 .
19	46 . 5 12 36 .
20	46 .
21	;
22
23	DATA RCT;
24	INPUT lTime rTime @@;
25	trt = 'RCT';
26	DATALINES;
27	8 12 0 5 30 34
28	0 22 5 8 13 .
29	24 31 12 20 10 17
30	17 27 11 . 8 21
31	17 23 33 40 4 9
32	24 30 31 . 11 .
33	16 24 13 39 14 19
34	13 . 19 32 4 8
35	11 13 34 . 34 .
36	16 20 13 . 30 36
37	18 25 16 24 18 24
38	17 26 35 . 16 60
39	32 . 15 22 35 39
40	23 . 11 17 21 .
41	44 48 22 32 11 20
42	14 17 10 35 48 .
43	;
44
45	DATA BCS;
46	SET RT RCT;
47	RUN;

2 Bloc de code

PROC ICLIFETEST

Explication :
Première analyse de survie. L'option 'plots=survival(cl)' demande le tracé de la courbe de survie avec les limites de confiance. 'impute(seed=1234)' active l'imputation pour les intervalles censurés avec une graine aléatoire fixée pour la reproductibilité. 'strata trt' définit la variable de groupe.

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1	PROC ICLIFETEST DATA=BCS plots=survival(cl) impute(seed=1234);
2	strata trt;
3	time (lTime, rTime);
4	RUN;

3 Bloc de code

PROC ICLIFETEST

Explication :
Seconde analyse similaire à la première, mais l'option graphique 'nodash' est ajoutée pour que les courbes de confiance soient tracées en traits pleins plutôt qu'en pointillés.

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1	PROC ICLIFETEST DATA=BCS plots=survival(cl nodash) impute(seed=1234);
2	strata trt;
3	time (lTime, rTime);
4	RUN;

4 Bloc de code

PROC ICLIFETEST

Explication :
Troisième analyse. L'option 'strata=panel' demande de séparer les graphiques de chaque strate (groupe de traitement) dans des panneaux distincts.

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1	PROC ICLIFETEST DATA=BCS plots=survival(cl strata=panel) impute(seed=1234);
2	strata trt;
3	time (lTime, rTime);
4	RUN;

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