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Estadística CREACION_INTERNA

Estadística de Prueba de Puntuación de Dean (1992)

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El script comienza creando un conjunto de datos interno 'toxoplasmosis' a través de un DATA STEP y datalines, incluyendo variables para el número de éxitos (t), el número total de ensayos (m) y una variable 'rain' (lluvia) que se copia en 'z'. Luego, la variable 'z' se estandariza utilizando PROC STDIZE. Se utiliza una PROC GLIMMIX para ajustar un modelo lineal generalizado mixto con un enlace logit y una distribución binomial, modelando 't/m' en función de 'z', 'z*z' y 'z*z*z'. Las predicciones del modelo se exportan para el cálculo de la estadística de puntuación. Un DATA STEP subsiguiente calcula los términos intermedios necesarios para la prueba. PROC MEANS agrega estos términos, y un último DATA STEP calcula la estadística Z de la prueba de puntuación y su valor p asociado. Finalmente, PROC PRINT muestra los resultados en una salida HTML formateada.
Análisis de datos

Type : CREACION_INTERNA


Los datos se crean directamente en el script a través de un DATA STEP y 'datalines'.

1 Bloque de código
DATA STEP Data
Explicación :
Este bloque DATA STEP crea el conjunto de datos 'toxoplasmosis' leyendo datos brutos (t, m, rain) directamente de las 'datalines'. Se crea una nueva variable 'z' como una copia de la variable 'rain'.
¡Copiado!
1 DATA toxoplasmosis;
2 INPUT t m rain;
3 z = rain;
4 DATALINES;
5 2 4 1735
6 3 10 1936
7 1 5 2000
8 3 10 1973
9 2 2 1750
10 3 5 1800
11 2 8 1750
12 7 19 2077
13 3 6 1920
14 8 10 1800
15 7 24 2050
16 0 1 1830
17 15 30 1650
18 4 22 2200
19 0 1 2000
20 6 11 1770
21 0 1 1920
22 33 54 1770
23 4 9 2240
24 5 18 1620
25 2 12 1756
26 0 1 1650
27 8 11 2250
28 41 77 1796
29 24 51 1890
30 7 16 1871
31 46 82 2063
32 9 13 2100
33 23 43 1918
34 53 75 1834
35 8 13 1780
36 3 10 1900
37 1 6 1976
38 23 37 2292
39 ;
2 Bloque de código
PROC STDIZE
Explicación :
Este procedimiento estandariza la variable 'z' en el conjunto de datos 'toxoplasmosis'. El conjunto de datos de salida sobrescribe el original, asegurando que los cálculos posteriores utilicen la versión estandarizada de 'z'.
¡Copiado!
1 
2PROC STDIZE
3DATA=toxoplasmosis out=toxoplasmosis;
4var z;
5 
6RUN;
7 
3 Bloque de código
PROC GLIMMIX
Explicación :
PROC GLIMMIX se utiliza para ajustar un modelo lineal generalizado mixto. El modelo especifica una respuesta binomial (t/m), una función de enlace logit, e incluye 'z', 'z*z' y 'z*z*z' como predictores. La opción 's' solicita estadísticas de resumen. La cláusula 'output' crea un nuevo conjunto de datos 'pdata' que contiene las probabilidades predichas ('pi') sin los efectos aleatorios (noblup) y en la escala de respuesta (ilink).
¡Copiado!
1 ods select none;
2 PROC GLIMMIX DATA=toxoplasmosis;
3 model t/m = z z*z z*z*z / link=logit dist=bin s;
4 OUTPUT out=pdata pred(noblup ilink) = pi;
5 RUN;
6 ods select all;
4 Bloque de código
DATA STEP
Explicación :
Este DATA STEP lee el conjunto de datos 'pdata' (creado por GLIMMIX) y calcula varias variables intermedias ('pic', 'pipic', 'mpi', 't_mpi', 'pit_mpi', 'tpic', 'mm_1', 'aux') necesarias para la fórmula de la estadística de prueba de puntuación de Dean. Solo 'aux' y 'mm_1' se mantienen para los pasos posteriores.
¡Copiado!
1 DATA pdata;
2 SET pdata;
3 pic = 1 - pi;
4 pipic = pi * pic;
5 mpi = m * pi;
6 t_mpi = t - mpi;
7 pit_mpi = pi * t_mpi;
8 tpic = t * pic;
9 mm_1 = m * (m-1);
10 aux = ( t_mpi*t_mpi + pit_mpi - tpic ) / pipic;
11 keep aux mm_1;
12 RUN;
5 Bloque de código
PROC MEANS
Explicación :
PROC MEANS se utiliza aquí para calcular la suma de las variables 'aux' y 'mm_1' en todo el conjunto de datos 'pdata'. El resultado se almacena en un nuevo conjunto de datos llamado 'new', y la opción 'noprint' suprime la visualización de la salida predeterminada de PROC MEANS.
¡Copiado!
1 PROC MEANS DATA=pdata sum noprint;
2 var aux mm_1;
3 OUTPUT out=new sum=aux mm_1;
4 RUN;
6 Bloque de código
DATA STEP
Explicación :
Este DATA STEP lee el conjunto de datos 'new' (que contiene las sumas de 'aux' y 'mm_1') y calcula la estadística Z de la prueba de puntuación, así como su valor p ('pval'). Se aplican formatos y etiquetas a las variables para una mejor presentación.
¡Copiado!
1 DATA new;
2 SET new;
3 label Z = "GOF Test";
4 label PVal = "P-Value";
5 FORMAT Z 8.2 Pval pvalue6.;
6 z = aux / sqrt( 2*mm_1 );
7 pval = 1 - probnorm( z );
8 RUN;
7 Bloque de código
PROC PRINT
Explicación :
Este bloque genera la salida final. ODS HTML se activa para dirigir la salida a un archivo HTML (o al entorno SAS Studio). Se define un título. PROC PRINT se utiliza para mostrar las variables 'z' (estadística de la prueba) y 'pval' (valor p) del conjunto de datos 'new'. Las opciones 'noobs' suprimen el número de observación y 'label' utiliza las etiquetas definidas para los encabezados de columna. Luego se cierra ODS HTML.
¡Copiado!
1 ods html;
2 title "Score Test Statistic, Dean (1992)";
3 PROC PRINT DATA=new noobs label;
4 var z pval;
5 RUN;
6 ods html close;
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Información de copyright : Score Test Statistic, Dean (1992). Example from Efron (1978, 1986).