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Estadística CREATION_INTERNE

Análisis de supervivencia: Cáncer de laringe (Cox y Kaplan-Meier)

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El script crea un conjunto de datos interno que contiene los tiempos de supervivencia, el indicador de censura, el estadio de la enfermedad y la edad. Genera variables indicadoras para los estadios. Se utiliza el procedimiento PHREG para modelar el riesgo en función del estadio y la edad, con pruebas de hipótesis lineales (Wald) para comparar los diferentes estadios. Finalmente, el procedimiento LIFETEST genera las curvas de supervivencia de Kaplan-Meier y las curvas de riesgo estratificadas por estadio.
Análisis de datos

Type : CREATION_INTERNE


Los datos se definen directamente en el script (datalines) y se refieren a tiempos de fallecimiento, censura, estadio y edad en el diagnóstico.

1 Bloque de código
DATA STEP Data
Explicación :
Creación del conjunto de datos 'ex1_8b' que contiene la información clínica. Las variables son el tiempo, la censura, el estadio, la edad y el año del diagnóstico.
¡Copiado!
1DATA ex1_8b;
2INPUT time censor stage age_diag yr_diag;
3lines;
40.6 1 1 77 76
51.3 1 1 53 71
62.4 1 1 45 71
7/* ... données tronquées pour l'affichage ... */
84.3 0 4 48 76
9;
2 Bloque de código
DATA STEP Data
Explicación :
Paso de preparación de datos: creación de variables indicadoras (dummy variables) 'stage2', 'stage3', 'stage4' para representar los niveles categóricos de la variable 'stage' en los modelos de regresión.
¡Copiado!
1DATA ex1_8b; SET ex1_8b;
2title 'Example 1.8, page 9 data -- Death Times of Male Laryngeal Cancer Patients';
3title3 'Proportional Hazards Regression Model -- Local Tests';
4stage2=(stage=2);
5stage3=(stage=3);
6stage4=(stage=4);
7RUN;
3 Bloque de código
PROC PRINT
Explicación :
Muestra el contenido del conjunto de datos preparado para verificación.
¡Copiado!
1PROC PRINT DATA=ex1_8b;
2RUN;
4 Bloque de código
PROC PHREG
Explicación :
Modelo de Cox que incluye la edad y los indicadores de estadio. Se utilizan instrucciones TEST para probar el efecto global del estadio (no_stage) y realizar comparaciones por pares entre los estadios.
¡Copiado!
1PROC PHREG DATA=ex1_8b;
2model time*censor(0) = stage2-stage4 age_diag;
3no_stage:test stage2,stage3,stage4;
4st2_st3: test stage2=stage3;
5st2_st4: test stage2=stage4;
6st3_st4: test stage3=stage4;
7RUN;
5 Bloque de código
PROC PHREG
Explicación :
Segundo modelo de Cox que incluye solo los indicadores de estadio (sin la edad), con pruebas de igualdad entre los coeficientes de los diferentes estadios.
¡Copiado!
1PROC PHREG DATA=ex1_8b;
2model time*censor(0) = stage2-stage4;
3test stage2=stage3;
4test stage3=stage4;
5test stage2=stage4;
6RUN;
6 Bloque de código
PROC LIFETEST
Explicación :
Análisis no paramétrico de la supervivencia (método actuarial/Life-Table o Kaplan-Meier según las opciones por defecto si method=life no se especifica, aquí 'method=life' solicita el método actuarial). Produce gráficos de la función de supervivencia (s) y de riesgo (h), estratificados por estadio.
¡Copiado!
1PROC LIFETEST DATA=ex1_8b method=life plots=(s,h) graphics;
2time time*censor(0);
3strata stage;
4symbol1 v=none color=red line=1;
5symbol2 v=none color=blue line=2;
6symbol3 v=none color=green line=3;
7RUN;
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