Initialisierung der Projektumgebung

Schwierigkeitsgrad

Anfänger

Veröffentlicht am : 06/07/2025

Das Makro `initlilly_setup` wurde entwickelt, um eine standardisierte Arbeitsumgebung zu konfigurieren. Es benötigt drei Parameter: `phase2` (Standard 'qa'), `ref` (Standard 'TDTM') und `PorV` (Standard 'programs_stat').
Es erkennt das Betriebssystem (`%sysscp`), um den Pfadtrenner (`sep`) und die Logik zur Pfaddefinition anzupassen. Für Windows zerlegt es die Makrovariable `pathroot` in verschiedene Segmente (Laufwerkstamm, Stammverzeichnis, Entwicklungsphase, Verbindung, Studie, Analysephase) und verwendet diese Segmente, um die Pfade der Bibliotheken `arcmeta`, `rptlib`, `sdtm` und `adam` zu konstruieren. Es enthält auch eine externe Formatierungsdatei. Für Unix wird angenommen, dass die Makrovariablen der Pfade (`arcmeta`, `rptlib`, `rptlibv`, `dev_path`, `val_path`, `bum_path`, `format_intrm1`) bereits außerhalb des Makros definiert sind, und verwendet diese, um die Bibliotheken zu definieren und die Formatierungsdatei einzuschließen. Schließlich definiert es eine globale Variable `studyid` basierend auf dem Namen der Verbindung.

Datenanalyse

Type : EXTERNE

Das Makro manipuliert nicht direkt Daten, stellt aber die notwendigen Verbindungen zu externen Datenquellen her. Die SAS-Bibliotheken (`arcmeta`, `rptlib`, `sdtm`, `adam`) werden so definiert, dass sie auf Dateisystemverzeichnisse zeigen, in denen Projektdaten (SDTM, ADAM) und Metadaten (arcmeta) gespeichert sind. Der Pfad zu diesen Verzeichnissen wird dynamisch aus der Variablen `pathroot` (für Windows) konstruiert oder es wird angenommen, dass er (für Unix) vordefiniert ist.

1 Codeblock

Makro-Definition

Erklärung :
Dieser Block definiert das Makro `initlilly_setup`. Es initialisiert globale Makrovariablen (`os`, `sep`, `drive_root`, usw.), die zum Aufbau von Dateipfaden und Projektverzeichnissen verwendet werden. Die bedingte Logik (`%if %upcase(&sysscp) = WIN %then ... %else`) passt Pfade und Dateitrenner je nach Betriebssystem an. `libname`-Anweisungen werden verwendet, um SAS-Bibliotheksnamen physischen Pfaden zuzuordnen, was den Zugriff auf Metadaten (`arcmeta`), Berichtausgaben (`rptlib`) und standardisierte klinische Datensätze (`sdtm`, `adam`) erleichtert. Für Windows werden Pfade dynamisch aus einer `pathroot`-Variable und Makroparametern konstruiert. Für Unix wird angenommen, dass die vollständigen Pfade bereits über Makrovariablen übergeben werden. Schließlich wird eine externe Formatierungsdatei (`%include`) eingeschlossen, um spezifische Formate auf die Daten anzuwenden. Die Variable `studyid` wird ebenfalls definiert.

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%macro initlilly_setup(phase2=qa,ref=TDTM,PorV=programs_stat); %initlilly; %global os sep drive_root dir_root dev_phase dev_phase2 compound study analy_phase referenc pgm_dir studyid trt1 trt2 trt3 trt4 trt5; %if %upcase(&sysscp) = WIN %then %do; %let os = %lowcase(&sysscp); %let sep=\\; /* Note: backslash escaped for JSON output */ /*Set up directory macro variables and the libraries*/ %let drive_root=%scan(&pathroot,1,&sep); /*Drive*/ %let dir_root=%scan(&pathroot,2,&sep); /*root directory*/ %let dev_phase=%scan(&pathroot,3,&sep);/*development phase before DBL*/ %let dev_phase2=&phase2;/*development phase after DBL*/ %let compound=%scan(&pathroot,4,&sep); /*compound name*/ %let study=%scan(&pathroot,5,&sep); /*study name*/ %let analy_phase=%scan(&pathroot,6,&sep); /*need to change when starting another interim lock*/ %let referenc=&ref; /*need to change after prd data is ready*/ %let pgm_dir=&porv;/*program location*/ libname arcmeta "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\data\shared\arc_reporting_metadata"; /*location of arc tool metadata*/ libname rptlib "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\&pgm_dir\tfl_output"; /*location of outputs*/ libname sdtm "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\data\shared\sdtm" access=readonly; libname adam "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\data\shared\adam" access=readonly; /*options errorcheck=strict serror mprint mlogic mlogicnest symbolgen notes source nosource2 nocenter nodate nonumber fmtsearch=(work);*/ /*Include output formatting*/ %include "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\programs_stat\format_hhbh.sas"; %end; %else %do; %let os = unix; %let sep=%str(/); libname arcmeta "&arcmeta"; /*location of arc tool metadata*/ libname rptlib "&rptlib"; /*location of outputs*/ libname rptlibv "&rptlibv"; /*location of independent programming outputs*/ /*Set up the study programming environment*/ options sasautos=("&dev_path" "&val_path" "&bum_path" sasautos) mautosource; /*options errorcheck=strict serror mprint mlogic mlogicnest symbolgen notes source nosource2 nocenter nodate nonumber fmtsearch=(work);*/ /*Include output formatting*/ %include &format_intrm1; %end; %let studyid=%upcase(&compound); %mend;

1	%macro initlilly_setup(phase2=qa,ref=TDTM,PorV=programs_stat);
2	%initlilly;
3	%global os sep drive_root dir_root dev_phase dev_phase2 compound study analy_phase referenc pgm_dir
4	studyid trt1 trt2 trt3 trt4 trt5;
5	%IF %upcase(&sysscp) = WIN %THEN
6	%DO;
7	%let os = %lowcase(&sysscp);
8	%let sep=\\; /* Note: backslash escaped for JSON output */
9	/Set up directory macro variables and the libraries/
10	%let drive_root=%scan(&pathroot,1,&sep); /Drive/
11	%let dir_root=%scan(&pathroot,2,&sep); /root directory/
12	%let dev_phase=%scan(&pathroot,3,&sep);/development phase before DBL/
13	%let dev_phase2=&phase2;/development phase after DBL/
14	%let compound=%scan(&pathroot,4,&sep); /compound name/
15	%let study=%scan(&pathroot,5,&sep); /study name/
16	%let analy_phase=%scan(&pathroot,6,&sep); /need to change when starting another interim lock/
17	%let referenc=&ref; /need to change after prd data is ready/
18	%let pgm_dir=&porv;/program location/
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20	LIBNAME arcmeta "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\data\shared\arc_reporting_metadata"; /location of arc tool metadata/
21	LIBNAME rptlib "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\&pgm_dir\tfl_output"; /location of outputs/
22	LIBNAME sdtm "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\data\shared\sdtm" access=readonly;
23	LIBNAME adam "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\data\shared\adam" access=readonly;
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25	/options errorcheck=strict serror mprint mlogic mlogicnest symbolgen notes source nosource2 nocenter nodate nonumber fmtsearch=(work);/
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27	/Include output formatting/
28	%include "&drive_root\&dir_root\&dev_phase\&compound\&study\&analy_phase\programs_stat\format_hhbh.sas";
29	%END;
30	%ELSE
31	%DO;
32	%let os = unix;
33	%let sep=%str(/);
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35	LIBNAME arcmeta "&arcmeta"; /location of arc tool metadata/
36	LIBNAME rptlib "&rptlib"; /location of outputs/
37	LIBNAME rptlibv "&rptlibv"; /location of independent programming outputs/
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39	/Set up the study programming environment/
40	options sasautos=("&dev_path" "&val_path" "&bum_path" sasautos) mautosource;
41	/options errorcheck=strict serror mprint mlogic mlogicnest symbolgen notes source nosource2 nocenter nodate nonumber fmtsearch=(work);/
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43	/Include output formatting/
44	%include &format_intrm1;
45	%END;
46	%let studyid=%upcase(&compound);
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49	%mend;

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Zugehörige Dokumentation

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